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[文献速递Vol.281]-扫描光场层析成像实现高速高分辨率各向同性三维成像

[文献速递Vol.281]-扫描光场层析成像实现高速高分辨率各向同性三维成像
撰稿人 |  王思颖

 

TITLE  |  #扫描光场层析成像实现高速高分辨率各向同性三维成像#

01

 

论文导读

 

文章提出了一种名为扫描光场层析成像(SLiT)的技术,用于快速、高分辨率地成像大规模透明样本或清除组织。这项技术能够在30秒内完成 6×6×6mm³ 样本的成像,具有近乎各向同性的细胞级分辨率。

 

02

 

研究背景

 

1. 生物学应用需求:在肿瘤学、神经科学和发育生物学等领域,对大规模透明样本或清除组织的体内成像需求日益增长,以理解器官水平上大规模细胞的功能和组织。

 

2. 传统方法局限性:传统成像技术如光片荧光显微镜(LSFM)和光学投影层析成像(OPT)在分辨率和成像深度上存在局限,尤其是在大规模样本的高分辨率成像中,面临视场深度(DOF)小和光学像差的问题。

03

 

技术突破

 

1. 提出了一种紧凑的低成本方法,即扫描光场层析成像(SLiT)系统,用于对大型样品进行高速高分辨率整体三维成像,近乎各向同性分辨率。

 

2. 扫描光场可将每个视点的景深提高超过10倍,而无需额外的轴向扫描来提高成像速度。6×6×6 mm³的大体积内光子能够高效聚焦用于三维重建,而传统OPT中仅有来自单个二维层的光子有效。

3. 开发了迭代多视图相位空间去卷积(IMPD)方法,结合多视图去卷积和三维像差校正,实现近乎各向同性的高分辨率三维重建。

4. SLiT技术能够在30秒内完成大规模样本的成像,相比传统技术,显著提高了成像速度。

04

 

方法

 

1) 扫描光场层析成像(SLiT)技术

 

SLiT技术通过替换OPT中的宽场检测为扫描光场检测,显著增强了每个视点的视场深度(DOF),从而提高了成像速度。在SLiT中,样本的光场被物镜捕获并投影到微透镜阵列上,传感器放置在后焦平面。通过扫描振镜进行图像平面的横向扫描,可以有效地缓解由于微透镜尺寸小而引入的频率混叠,从而显著提高空间分辨率。

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图1. SLiT的原理和性能。

 

SLiT技术能够在不需要额外轴向扫描的情况下,对6×6×6mm³的大体积样本进行3D重建,同时保持高效率。与传统OPT相比,SLiT只需要24个投影而不是传统OPT所需的数百个,进一步加快了成像速度。

 

2) 多共轭数字自适应光学(MDAO)

MDAO基于先前的数字自适应光学技术,通过多层模型校正由复杂光学像差引起的视点间图像失配。光学像差被建模为由不同深度的多层虚拟相位板引起的3D变形。通过在无像差光学系统的模拟中添加虚拟相位板,可以模拟像差对成像结果的影响。

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图2. MDAO增强了荧光珠的重建性能SLiT成像结果及其各自的分辨率等。

 

为了评估SLiT的性能,对分散在1%琼脂糖凝胶中的1µm直径荧光微球进行了三维成像。在没有MDAO校正的情况下,多个视角之间存在严重的匹配不佳,伴随强烈的伪影和低分辨率。经过MDAO校正后,多视角可以被修正并以更高的空间分辨率对齐,且无伪影出现[图2(a)–2(f)]。进一步计算SLiT重建中微球的半高全宽(FWHM),发现横向轴向分辨率几乎相同,并且在整个体积中保持一致,结合了多点三维像差校正[图2(g)]。不同视角的估计相位如图2(h)所示。视角之间的对齐以及与重建结果的相关性证明了MDAO估计的有效性和合理性。

 

3) 迭代多视图相空间去卷积(IMPD)方法

IMPD方法基于DAOSLIMIT的相空间迭代去卷积方法,包含相空间投影和反投影步骤。相空间投影步骤是从估计体积到光场测量的投影,而反投影步骤使用测量和前向投影之间的误差来更新3D体积。

05

 

结果

 

为了进一步评估SLiT在生物样本上的性能,使用 5×/NA 0.14 的物镜对发育中的斑马鱼血管进行了大体积成像。同时,还用 4×/NA 0.13 的激光扫描共聚焦显微镜(LSCM)对同一样本进行了成像,以便进行比较。SLiT和LSCM(从0°视角捕获)的数据均进行了手动配准以便比较[图3(a)]。由于样本散射,LSCM未能成像鱼的背部眼部。SLiT的成像速度远快于LSCM,并且由于旋转过程,其轴向分辨率甚至更高。各种视图的最大强度投影(MIP)显示了详细的血管结构(图3(b))。

 

此外,为了进一步展示SLiT在大规模清除组织上的优势,对几种不同类型的样本进行了成像,例如小鼠脑中的神经元(图4,图S8)、小鼠眼中的血管(图4,图S7)。通过SLiT,能够在短时间内获得高分辨率的三维成像,捕捉到细胞层面的详细结构。这些结果表明,SLiT在处理大规模透明样本时,不仅提高了成像速度,还显著改善了图像质量,克服了传统成像方法在处理厚样本时的局限性。SLiT系统在生物样本的多样性和复杂性方面表现出了出色的适应性,为未来在生物医学研究中深入探索细胞组织的功能和相互作用提供了新的可能性。

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图3. SLiT 和 LSCM 斑马鱼血管成像结果的比较。

 

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图4. 多种透明组织的中尺度体积成像。

 

06

 

研究意义

 

1. 高成像速度:SLiT技术能够在30秒内完成大规模样本的成像,相比传统技术,显著提高了成像速度。

 

2. 高分辨率:SLiT技术实现了近乎各向同性的细胞级分辨率,这对于探索大规模细胞组织和器官间的相互作用具有重要意义。

3. 强大的鲁棒性:SLiT技术对于光学像差具有很强的鲁棒性,这使得它在实际应用中更加可靠。

4. 广泛的应用前景:SLiT技术在多种样本上展示了其多功能性和优势,包括斑马鱼血管、清除的小鼠大脑、血管染色的清除小鼠眼睛和骨染色的清除小鼠头部等,表明了其在大规模透明样本成像中的广泛应用潜力。

文章链接

 

https://doi.org/10.1364/OPTICA.534412

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